近日，上海科技大学免疫化学研究所特聘教授蒋华良院士团队在《Journal of Medicinal Chemistry》发表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Graph Attention Mechanism”，介绍了一种基于注意力机制的图神经网络模型（Attentive FP）。该模型可以用于分子表征，在多个药物发现相关的数据集上的预测表现达到当前最优，并且该模型所学到的内容具有可解释性。可解释性人工智能（Explainable AI）是AI的前沿研究方向之一，聚焦于用系统性和可解释的方式呈现人工智能所学习到的复杂逻辑，让人工智能的预测依据更好地被人类理解。人工智能药物设计研究的重点之一也是如何针对性地开发了更符合化学背景、更易于解读的模型。在Attentive FP中，研究人员使用图神经网络处理含有原子和键的分子图结构，并通过引入原子水平和分子水平的注意力机制，使得到的分子图模型兼具推理能力和可解释性。对模型隐藏层神经元进行...

近日，我校物质学院材料与物理生物学研究部钟超课题组利用基因工程改造的方法开发出生物被膜，用于负载和固定功能纳米材料，并将这种生物被膜／无机纳米杂化材料首次应用在环境和能源催化领域。该研究成果以“Immobilization of Functional Nano-objects in Living Engineered Bacterial Biofilms for Catalytic Applications”为题，在知名期刊《National Science Review》上在线发表（DOI: org/10.1093/nsr/nwz104）。纳米材料的尺寸通常在1纳米到100纳米之间，与传统的块状材料相比，具备更大的比表面积和更多的表面活性位点，因此非常适合设计纳米催化剂。然而，在纳米催化剂的具体使用过程中，由于其尺寸较小，相应也带来了较难回收、容易造成二次污染等问题。普适性的解决方案就是对纳米催化剂进行固定，然而传统的固定方法较为繁琐，并且不具备活体材料的可再生和易于规模化等优点。本研究基于大肠杆菌的生物被膜开发了功能纳米材料的负载方法，引入了活...

近日，知名学术杂志《ACS Nano》在线发表了由上海科技大学物质学院薛加民、郭艳峰以及上海技术物理研究所胡伟达课题组合作完成的研究论文，题为“Nb2SiTe4:A Stable Narrow-Gap Two-Dimensional Material with Ambipolar Transport and Mid-Infrared Response”，报道了他们在新型窄带隙二维材料方面所取得的重要研究进展。窄带隙二维材料具有栅极可调控的载流子类型以及对红外光谱的响应，因此具有很高的研究和应用价值。然而，目前绝大部分已发现的二维材料都具有1 eV以上的较宽带隙，在电学输运中，往往只能实现单一载流子类型和较短波长的响应。少数几种具有窄带隙的二维材料，如黑磷等，在大气环境下很容易和水氧发生反应而分解。因此，获得新型稳定的窄带隙材料是当前研究的一个难点。薛加民、郭艳峰和胡伟达课题组通过合作研究发现，一种三元二维材料Nb2SiTe4（晶格结构如图一中插图所示）具有合适的带隙（~ 0.4 eV）。通过制备少层Nb2SiTe4的场效...

近日，国际计算机视觉会议ICCV2019录用结果公布，信息学院何旭明教授课题组、高盛华教授课题组、虞晶怡教授课题组共有4篇论文被接收。国际计算机视觉大会（International Conference on Computer Vision，ICCV）是计算机视觉领域中最高级别的国际学术会议之一，由IEEE（电气电子工程师学会）举办，每两年在世界范围内召开一次，在业内具有极高的评价。今年，计算机视觉国际顶会ICCV 2019共收到4350篇提交论文，录用1050篇，接收率为24%，其中850篇为poster报告论文，200篇为oral报告论文。信息学院的何旭明教授课题组共有2篇论文被接收。“Pose-aware Multi-level Feature Network for Human Object Interaction Detection”一文提出了一种新颖的人-物体交互检测模型，在多个数据集上该方法展现出大大优于现有最佳方法的性能。在人-物体交互检测任务中，人与物体交互方式的多样性以及交互场景的复杂性，相比于传统的视觉任务存在更多挑战。研究人员提出了一种多...

2019年8月29日，由上海科技大学免疫化学研究所特聘教授饶子和院士率领的科研团队与上海科技大学生命科学与技术学院特聘教授、中科院生物物理研究所胡俊杰研究员课题组合作，在《Nature Communications》上发表题为“Mycobacterial dynamin-like protein IniA mediates membrane fission”的研究论文。他们率先解析了一线抗结核药物——异烟肼诱导蛋白IniA的apo状态以及GTP结合态的三维空间结构，发现其具有类似细菌动力蛋白的折叠方式，并发挥膜分裂的功能，最终揭开了IniA 蛋白参与药物耐受的新机制，对解决结核病耐药性问题具有重要指导意义。结核病是由结核分枝杆菌感染引发的一种致命性传染病。人类与结核病抗争的历史已逾150多年。自从上个世纪中叶链霉素、吡嗪酰胺、异烟肼、乙胺丁醇、利福平等有效药物被发现并用于治疗结核病以来，这个严重威胁人类生命健康的传染病才得以控制。然而全世界目前仍有约1/3的人口被结核杆菌感染，每年新发和死亡人数十分庞大...

我校物质学院材料和物理生物学研究部钟超课题组利用基因模块方法理性设计并开发出基于哺乳动物低复杂序列蛋白的超强水下粘合涂层材料。该成果于 2019 年 8 月 23 日在《Science 子刊 Science Advances》上以“Exploiting mammalian low-complexity domains for liquid-liquid phase separation–driven underwater adhesive coatings”为题在线发表。该成果为如何在生物工程和生物材料领域开发和利用基于哺乳动物低复杂序列蛋白的液液相分离行为提供了重要启示（图1）。近年来，哺乳动物细胞内广泛存在的液液相分离（LLPS）现象备受生物学家关注，细胞内的蛋白分子可以通过液液相分离形成液态凝结物（liquid condensates），即无膜细胞器，调节细胞内的生理活动，在突变或恶劣条件下，液态凝结物会进一步形成与神经退行性疾病相关的病理性淀粉样蛋白纤维。细胞内蛋白的这种顺序自组装（sequential assemblies）在生物学领域的重要性逐渐被发现并认可，但是很少被...

2019年8月19日，上海科技大学iHuman研究所/生命学院钟桂生课题组、东南大学柴人杰课题组与复旦大学附属眼耳鼻喉科医院李华伟课题组合作在《Nature Communications》在线发表了题为“AAV-ie enables safe and efficient gene transfer to inner ear cells”的最新研究成果。该研究开发出一种可用于耳聋基因治疗的AAV新变体，命名为AAV-ie （AAV-inner ear）。相较传统的血清型AAV，AAV-ie能够高效且安全地靶向小鼠内耳的各种组织细胞且在支持细胞（Supporting cell）上显示出优于其它AAV的感染率。而且，AAV-ie也能高效感染人的内耳组织细胞，表明其具有临床应用的潜力。目前，相关研究已经鉴定出超过3000个基因的突变会导致符合孟德尔遗传的疾病[1]。基因治疗利用载体将外源正常基因或者基因编辑工具导入靶细胞，从而达到纠正基因缺陷的目的。该方法能在根源上解决基因突变所导致的疾病。腺相关病毒（AAV）以其高细胞感染性和低免疫原性成为现阶段基因治疗的理想...

近日，我校物质学院陈刚教授课题组在钙钛矿太阳能电池的制备与机理探究方面再次取得重要进展。他们通过创新性地引入一种季胺有机阳离子，制备了新型二维钙钛矿薄膜，进而通过对薄膜内部晶粒取向性的操控调节，实现了高性能高稳定性的二维钙钛矿太阳能电池的制备。目前，该成果以“A New Organic Interlayer Spacer for Stable and Efficient 2D Ruddlesden-Popper Perovskite Solar Cells”为题，发表于国际知名学术期刊《Nano Letters》。作为一项颠覆性的新兴光伏技术，近年来，钙钛矿太阳能电池的光电转换效率实现了长足发展。而其环境稳定性问题，即在高湿度/温度条件下的退化问题严重制约了其进一步产业化应用。已有研究表明，在钙钛矿晶体中引入长链有机阳离子，形成二维钙钛矿结构可以有效提高此种材料的环境稳定性。而当前主要应用伯胺离子作为长链有机阳离子间隔层，尚未对其进一步的优化做出有体系有目的的筛选。在这一项研究中，陈刚教授团队引入一...

近日，我校物质学院陈宇林-柳仲楷课题组在拓扑外尔半金属的电子结构人工调控研究中取得重要进展：采用表面修饰的方式，首次实现外尔半金属表面费米弧的原位操纵并直接观察到拓扑Lifshitz转变。目前该成果以“Topological Lifshitz transitions and Fermi arc manipulation in Weyl semimetal NbAs”为题，在知名学术期刊《Nature Communications》上在线发表。拓扑外尔半金属是近年来发现的重要拓扑量子材料之一。它具有奇特的拓扑电子能带结构：该种材料的体内导带和价带线性接触形成 (成对出现) 具有手性的外尔点，不同手性的外尔点由奇特的拓扑表面费米弧（非封闭的费米面）所连接。这些非平庸的拓扑能带结构能导致一系列重要的物理现象，包括手性反常、三维量子霍尔效应、非局域电压产生效应等。为了研究外尔半金属的拓扑性质和有效实现其器件的开发应用，对其拓扑电子结构进行人工调控至关重要。在此次发表的工作中，陈宇林-柳仲楷课题组通过超高真空...

有机-无机杂化钙钛矿发光材料以其半峰宽窄、色域可调、高量子产率等一系列优异的性能而备受关注。经过短短数年的发展，钙钛矿材料发光二极管器件的外量子效率便已突破20%，是下一代高分辨率显示设备的有力竞争者之一。然而，稳定性问题严重阻碍了该材料在电致发光器件中的发展和应用，由于钙钛矿结构的形成能较低，钙钛矿结构在电场和外界水氧存在的条件下容易发生结构解离和离子迁移，造成材料本身发光光谱变化和发光二极管器件工作寿命较短。稳定性的提升是该材料在平板显示领域商业化应用的重大挑战。我校物质学院宁志军、刘伟民和柯友启课题组合作在有机-无机杂化钙钛矿发光器件的稳定性研究上取得重要进展。近日，该成果以“Highly Stable Hybrid Perovskite Light-Emitting Diode Based on Dion-Jacobson Structure” 为题，于《Science》旗下子刊《Science Advances》上发表。这项研究首先通过第一性原理计算揭示相对于范德华力连接的Ruddlesden-Popper...

凝聚态体系中由于存在电荷、自旋、轨道等多种自由度，它们相互配合和竞争可以衍生出很多非平凡的物理结果，因此一直是人们研究的热点和新奇物性的实现平台。然而，正是由于多自由度的耦合，对于某种实验观测到的宏观物理现象主要是由何种微观机制所导致这一问题，在很多情况下难以理解清楚。其中非常具有代表性的问题是在过渡金属元素构成的半导体/绝缘体中，电子的能隙究竟是由电子电荷关联导致的，还是由电子自旋关联导致的，长久以来答案一直模糊不清。近日，我校物质学院助理教授李刚、柳仲楷和郭艳峰的研究团队通力合作，成功揭示了在低维量子体系CrSiTe3中电子关联所扮演的重要作用，首次明确地指出了该体系中的电子能隙主要源于电子间的库仑排斥作用。该项工作近日以“Unveiling Electronic Correlation and the Ferromagnetic Superexchange Mechanism in the van der Waals Crystal CrSiTe3”为题在国际顶尖物理杂志《Physical Review Letters》发表。...

近日，我校物质学院刘巍教授课题组在高性能锂离子电池的电极材料方面再次取得重要进展：他们突破传统电极结构，开发了具有致密结构、高负载量、低成本的新型电极结构，利用了冷烧结工艺并通过添加纳米离子导体来促进锂离子在电极内部传导的动力学过程。目前该成果以“High-Performance, Low-Cost, and Dense-Structure Electrodes with High Mass Loading for Lithium-Ion Batteries”为题，被国际知名学术期刊《Advanced Functional Materials》（《先进功能材料》）上发表。锂离子电池已经广泛应用在移动电子消费领域，但是目前传统锂离子电池的能量密度还无法满足电动汽车等大规模储能领域的需求。提高锂离子电池电极材料厚度和单位面积负载量是提高能量密度的方法之一。之前报道的研究方法大多是利用多孔结构来提高其面积容量，制备工艺复杂且成本较高。刘巍课题组首次提出了高致密度的新型电极结构，通过使用一种新型的冷烧结技术，使得无机电极氧化物材料...

我校物质学院李涛教授课题组在近期的研究成果中揭示了多层壳核多孔材料生长理论。近日，该成果以“Uncovering Two Kinetic Factors in the Controlled Growth of Topologically Distinct Core-Shell Metal-Organic Frameworks”为题，于国际知名化学期刊《Chemical Science》(《化学科学》)上发表。金属有机框架材料（metal-organic frameworks, MOFs）是一类具有周期性网络结构的晶态多孔材料。由于其多变且结构高度可设计的特征，MOFs材料被广泛认为是一类最具应用前景的新型多孔材料。然而，许多具有优异气体吸附和分离性能MOFs往往面临稳定性较差的缺点，而稳定性较高的MOFs则很少展现出优异的吸附特征。如果将高稳定性的MOFs作为壳层生长于高性能的MOFs内核外形成“壳核MOFs结构”则能结合两者各自的特点，极大地拓展了MOFs的应用范围。然而由于不同MOFs材料之间存在晶胞参数不匹配和配位化学属性不匹配的情况，使得壳核MOFs的合成充满了挑战。李涛课题组...

共价有机框架（Covalent Organic Frameworks, COFs）是由有机构筑基元通过强共价键链接起来的二维和三维多孔晶体，因其框架牢固性和分子精准性，以及新兴的动态响应行为而备受关注，在气体吸附与分离、能源转化与存储、盐水资源化和药物投递等方面有广阔的应用前景。最近，由我校物质学院章跃标教授和马延航教授合作的研究团队采用冷冻电子衍射技术首次实现了对一例具有客体依赖响应的三维COF材料的原子级动态结构解析。该项工作以“Atomic-Level Characterization of Dynamics of a 3D Covalent Organic Framework by Cryo-Electron Diffraction Tomography”为题，作为增选封面（Supplementary Cover）发表在国际顶尖化学期刊《美国化学会志》（Journal of the American Chemical Society）上。因为COFs是完全由强共价键链接，结晶可逆性较差，其晶体生长和结构解析是该领域长期以来的重大挑战。近来，采用亚胺交换合成策略虽然已经成功制备出COF单晶尺...